2012年3月10日土曜日

ゴリラゲノム

ヒト、チンパンジー、オランウータンに続いて最後の大型類人猿ゴリラのゲノムが解読されました。

Insights into hominid evolution from the gorilla genome sequence
Scally A, Dutheil JY, Hillier LW, Jordan GE, Goodhead I, Herrero J, Hobolth A, Lappalainen T, Mailund T, Marques-Bonet T, McCarthy S, Montgomery SH, Schwalie PC, Tang YA, Ward MC, Xue Y, Yngvadottir B, Alkan C, Andersen LN, Ayub Q, Ball EV, Beal K, Bradley BJ, Chen Y, Clee CM, Fitzgerald S, Graves TA, Gu Y, Heath P, Heger A, Karakoc E, Kolb-Kokocinski A, Laird GK, Lunter G, Meader S, Mort M, Mullikin JC, Munch K, O'Connor TD, Phillips AD, Prado-Martinez J, Rogers AS, Sajjadian S, Schmidt D, Shaw K, Simpson JT, Stenson PD, Turner DJ, Vigilant L, Vilella AJ, Whitener W, Zhu B, Cooper DN, de Jong P, Dermitzakis ET, Eichler EE, Flicek P, Goldman N, Mundy NI, Ning Z, Odom DT, Ponting CP, Quail MA, Ryder OA, Searle SM, Warren WC, Wilson RK, Schierup MH, Rogers J, Tyler-Smith C, Durbin R.
Nature. 2012 Mar 7;483(7388):169-75. doi: 10.1038/nature10842.
PMID: 22398555 [PubMed - in process]

ゴリラはチンパンジー/ボノボに次いでヒトに近い霊長類です。ゴリラゲノムの30%は、チンパンジーよりもヒトに近縁、あるいはヒトよりもチンパンジーに近縁であることがわかりました。これはincomplete lineage sortingと呼ばれ、祖先集団で保持されていた多型が異なった割合で子孫集団に受け継がれることによって起こる、種の系統関係と遺伝子の系統関係の不一致によるものです。これらの領域は遺伝子の周辺では少なくなっており、遺伝子への淘汰の影響を受けていない領域が偶然にincomplete lineage sortingを起こしているようです。

近年ゴリラは2種に分けられるのが定説となりつつありますが、そのニシゴリラとヒガシゴリラの分岐時期は175万年前くらいで、その後も遺伝子の交流は続き、ヒガシゴリラでは個体数の急減が起こったこともわかりました。

0 件のコメント:

コメントを投稿