2012年12月5日水曜日

CpG decayによる転写因子結合配列の形成

CpGはシトシンメチル化を受けている事が多いため、CからTへの置換を起こしやすいことが知られています。これはCpG decayと呼ばれ、ヒトでは最も多い塩基置換です。この論文の著者らは以前AluにCpG decayが起こる事でp53結合配列ができる事を報告しています.以下の論文では、Oct4、NANOG、c-Mycが結合するプロモーター領域では、CpG decayにより結合配列が作られる場合が他の置換に比べてはるかに多い事を示しています。

CpG deamination creates transcription factor-binding sites with high efficiency.
Zemojtel T, Kielbasa SM, Arndt PF, Behrens S, Bourque G, Vingron M.
Genome Biol Evol. 2011;3:1304-11. Epub 2011 Oct 19.
PMID: 22016335 [PubMed - indexed for MEDLINE] Free PMC Article

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