二次共生藻の核ゲノム

二次共生藻類とは一次共生により成立した真核藻類（緑藻、紅藻、灰色藻）が更に別の真核生物の細胞内に共生して成立した藻類のことです。二次共生藻類の内の２グループ、クリプト藻とクロララクニオン藻は二次共生の際に細胞内共生した藻類の核nucleomorphが１Mb以下と非常に小さいながらも残っています。

Algal genomes reveal evolutionary mosaicism and the fate of nucleomorphs
Curtis BA, Tanifuji G, Burki F, Gruber A, Irimia M, Maruyama S, Arias MC, Ball SG, Gile GH, Hirakawa Y, Hopkins JF, Kuo A, Rensing SA, Schmutz J, Symeonidi A, Elias M, Eveleigh RJ, Herman EK, Klute MJ, Nakayama T, Oborník M, Reyes-Prieto A, Armbrust EV, Aves SJ, Beiko RG, Coutinho P, Dacks JB, Durnford DG, Fast NM, Green BR, Grisdale CJ, Hempel F, Henrissat B, Höppner MP, Ishida K, Kim E, Kořený L, Kroth PG, Liu Y, Malik SB, Maier UG, McRose D, Mock T, Neilson JA, Onodera NT, Poole AM, Pritham EJ, Richards TA, Rocap G, Roy SW, Sarai C, Schaack S, Shirato S, Slamovits CH, Spencer DF, Suzuki S, Worden AZ, Zauner S, Barry K, Bell C, Bharti AK, Crow JA, Grimwood J, Kramer R, Lindquist E, Lucas S, Salamov A, McFadden GI, Lane CE, Keeling PJ, Gray MW, Grigoriev IV, Archibald JM.
Nature. 2012 Dec 6;492(7427):59-65. doi: 10.1038/nature11681. Epub 2012 Nov 28.
PMID: 23201678 [PubMed - in process]

この論文では、クリプト藻のGuillardia thetaとクロララクニオン藻のBigelowiella natansの各ゲノムを報告しています。細胞内輸送システムは非常に複雑で、核由来、nucleomorph由来、の両方の遺伝子が混ざり合ってミトコンドリア、細胞質、色素体、共生藻の細胞質への輸送をコントロールしています。また、ミトコンドリアから核への遺伝子移行はまだ起こっていますが、色素体から核、nucleomorphから核への遺伝子移行は起こっておらず、これがまだnucleomorphが残っていることの説明になりそうです。