2013年7月26日金曜日

転移因子・利己的遺伝因子の応用の論文まとめ

Structure-guided reprogramming of serine recombinase DNA sequence specificity.
Gaj T, Mercer AC, Gersbach CA, Gordley RM, Barbas CF 3rd.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Jan 11;108(2):498-503. Epub 2010 Dec 27.
セリンリコンビナーゼの仲間invertase GinとTn3 resolvaseの標的配列を、人工進化系を使って変える事に成功した論文。

Retargeting transposon insertions by the adeno-associated virus Rep protein.
Ammar I, Gogol-Döring A, Miskey C, Chen W, Cathomen T, Izsvák Z, Ivics Z.
Nucleic Acids Res. 2012 Aug;40(14):6693-712. doi: 10.1093/nar/gks317. Epub 2012 Apr 19.
PMID: 22523082 [PubMed - indexed for MEDLINE] Free PMC Article
アデノ随伴ウイルスのRepタンパク質を使って転移因子の挿入位置をある程度集中させることに成功した論文。

Chimeric piggyBac transposases for genomic targeting in human cells
Owens JB, Urschitz J, Stoytchev I, Dang NC, Stoytcheva Z, Belcaid M, Maragathavally KJ, Coates CJ, Segal DJ, Moisyadi S.
Nucleic Acids Res. 2012 Aug 1;40(14):6978-91. Epub 2012 Apr 9.
PMID: 22492708 [PubMed - in process] Free PMC Article
Gal4 DNA binding domainとpiggyBacの転移酵素を融合する事で4つに1つが標的のUASサイトに挿入されるようになった事を示す論文。

Chimeric TALE recombinases with programmable DNA sequence specificity
Mercer AC, Gaj T, Fuller RP, Barbas CF 3rd.
Nucleic Acids Res. 2012 Nov 1;40(21):11163-72. doi: 10.1093/nar/gks875. Epub 2012 Sep 26.
PMID: 23019222 [PubMed - in process] Free PMC Article
Xanthomonasのtranscription activator-like effector (TALE)のDNA結合ドメインをDNA invertase Ginにつないで、配列特異的な組換え酵素を作成した論文。zinc finger proteinを用いた系と相補される事が期待される。

Genomic deletion induced by Tol2 transposon excision in zebrafish
Huang P, Xu L, Liang W, Tam CI, Zhang Y, Qi F, Zhu Z, Lin S, Zhang B.
Nucleic Acids Res. 2013 Jan;41(2):e36. doi: 10.1093/nar/gks1035. Epub 2012 Nov 9.
PMID: 23143102 [PubMed - in process] Free PMC Article
Tol2挿入後に転移酵素のmRNAを導入する事で切り出しを誘発し、その結果を解析した論文。不正確に切り出されるTol2の性質がもしかしたら新しい応用につながるかも?という示唆あり。

0 件のコメント:

コメントを投稿