2013年10月23日水曜日

Repbase Reports 13(9)

今年のRepbase Reports第9号が出版されました。この号では、ニシキガメChrysemys picta、ヨウスコウアリゲーターAlligator sinensis、オウシュウトウヒPicea abiesの転移因子を報告しています。
Repbase Reports Volume 13, Issue 9

Repbase ReportsはGIRIが発行している、真核生物の反復配列を報告するオンラインの科学雑誌です。配列、分類と簡単な特徴の報告だけですが、反復配列の一次情報源として論文でも引用されています。Repbase Reportsに掲載された配列は、反復配列データベースであるRepbase Updateに収録され、配布されます。学術研究者はユーザー登録することでどちらも無料で閲覧できます。

2013年10月22日火曜日

Repbase Reports 13(8)

今年のRepbase Reports第8号が出版されました。この号でも、ニシキガメChrysemys pictaの転移因子を報告しています。
Repbase Reports Volume 13, Issue 8

Repbase ReportsはGIRIが発行している、真核生物の反復配列を報告するオンラインの科学雑誌です。配列、分類と簡単な特徴の報告だけですが、反復配列の一次情報源として論文でも引用されています。Repbase Reportsに掲載された配列は、反復配列データベースであるRepbase Updateに収録され、配布されます。学術研究者はユーザー登録することでどちらも無料で閲覧できます。

2013年10月21日月曜日

Keystone Symposia 2014

Flyerが来ていたので紹介。
Keystone Symposia 2014 "Mobile Genetic Elements and Genome Evolution" が2014年3月9日から14日までNew Mexico州Santa Feで開催されます。

Keystone Symposia 2014 "Mobile Genetic Elements and Genome Evolution"

2013年8月28日水曜日

生物系フリーソフトウェアインストール

私用で使っているMacBook Airが故障し、OSを再インストールした後、アプリケーションを再インストールしました。ちなみにOSはMacOSX 10.7.5 (Lion)。

以下は備忘録代わりのフリーソフトのリスト。

FigTree v.1.4.0
系統樹のビューワー。加工しやすいので重宝している。今回落としたのは、MacOSX executable version。

Mendeley Desktop v.1.9.2
文献管理ソフト。Web上に保存しておけるのは無料版では2GBまでなので以下のToGoDoc Clientと併用している。やがてはEndNoteを代替できるのか期待しているが…

ToGoDocClient v.1.2.5
同じく文献管理ソフト。iPapersが壊れたときに昔のファイルを移行したのでMendeleyと並行して使っている。

Skype v.6.8.0
ウェブ電話ソフト。電話会議やビデオ会議で必要。

DropBox v.2.0.26
クラウド。複数のコンピュータで仕事のファイルを見るために使用。

mi v.2.1.12r3
エディタ。改行なしの表示のためには、TextEditでは代用できないので。改行コード変換にも利用。


Evernote v.5.2.1(App Storeよりダウンロード&インストール)
なんでも記録ソフト。たまに生物系の論文のニュースなどをクリップする。

2013年8月5日月曜日

ヤガ2種の染色体地図

妻が北海道大学で働いていたときの研究成果がInsect Biochem Mol Biolに発表されました。

FISH identification of Helicoverpa armigera and Mamestra brassicae chromosomes by BAC and fosmid probes
Sahara K, Yoshido A, Shibata F, Fujikawa-Kojima N, Okabe T, Tanaka-Okuyama M, Yasukochi Y.
Insect Biochem Mol Biol. 2013 Apr 28;43(8):644-653. doi: 10.1016/j.ibmb.2013.04.003. [Epub ahead of print]
PMID: 23628856 [PubMed - as supplied by publisher]


鱗翅目昆虫2種オオタバコガHelicoverpa armigeraとヨトウガMamestra brassicae(どちらもヤガの仲間)の染色体をBAC-FISHにより同定した論文。