マウス系統間の挿入欠失多型

最近、次世代シーケンサー等を用いて大規模に系統間、個体間の挿入欠失多型を調べる研究を多く見ます｡以下の論文もその1種｡

Sequence-based characterization of structural variation in the mouse genome
Yalcin B, Wong K, Agam A, Goodson M, Keane TM, Gan X, Nellåker C, Goodstadt L, Nicod J, Bhomra A, Hernandez-Pliego P, Whitley H, Cleak J, Dutton R, Janowitz D, Mott R, Adams DJ, Flint J.
Nature. 2011 Sep 14;477(7364):326-9. doi: 10.1038/nature10432.

マウスの系統間で見つかる挿入欠失多型を711920個解析したところ､半分以上はレトロトランスポゾンの挿入であった。割合はLINEが最も多く（25%）､SINE（15%）、LTR retrotransposon（14%）と続く。多くではTSDも同定できた。