2011年12月18日日曜日

細胞性粘菌2種のゲノム

細胞性粘菌の2種、Dictyostelium fasciculatumPolysphondylium pallidumのゲノムが解読されました。既にDictyostelium discoideumのゲノムは読まれていますから合計で3種のゲノムが読まれたことになります。

Phylogeny-wide analysis of social amoeba genomes highlights ancient origins for complex intercellular communication
Heidel AJ, Lawal HM, Felder M, Schilde C, Helps NR, Tunggal B, Rivero F, John U, Schleicher M, Eichinger L, Platzer M, Noegel AA, Schaap P, Glöckner G.
Genome Res. 2011 Nov;21(11):1882-91. Epub 2011 Jul 14.

論文では、この3種が共通祖先から分岐したのは6億年以上前と推定しています。また転移因子の数は、Dictyostelium fasciculatumPolysphondylium pallidumではDictyostelium discoideumに比べてかなり少ないそうです。

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