タスマニアデビルのゲノム

最新号のRepbase Reportsでタスマニアデビルの転移因子が報告されているのでその関連です｡

感染性の癌（Devil Facial Tumor Disease）により急速に生息数が減少しているタスマニアデビルSarcophilus harrisiiのゲノムが解読されました。タスマニアデビルはフクロオオカミThylacinus cynocephalusの絶滅後、現生最大の肉食性有袋類です。著者らは2頭のタスマニアデビルのゲノムを次世代シーケンサーで解読しています。
これによると現在見られるタスマニアデビルの遺伝的多様性の低さはDFTDの流行よりも100年以上古いと見られるそうです。従って､DFTDの流行により多様性が減少したのではなく、逆に多様性の低さがDFTDの流行につながっているのかもしれません｡

Genetic diversity and population structure of the endangered marsupial Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil).
Miller W, Hayes VM, Ratan A, Petersen DC, Wittekindt NE, Miller J, Walenz B, Knight J, Qi J, Zhao F, Wang Q, Bedoya-Reina OC, Katiyar N, Tomsho LP, Kasson LM, Hardie RA, Woodbridge P, Tindall EA, Bertelsen MF, Dixon D, Pyecroft S, Helgen KM, Lesk AM, Pringle TH, Patterson N, Zhang Y, Kreiss A, Woods GM, Jones ME, Schuster SC.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Jul 26;108(30):12348-53. Epub 2011 Jun 27.