小島生物学御研究室でも「80. 脊椎動物ゲノムの中のRNAウイルス化石」として紹介したように、ここ1、2年の間に、ゲノムに挿入されたRNAウイルス配列が次々に見つかってきました。以下の論文もその1つで、節足動物の核ゲノム中にラブドウイルスの配列が挿入されている事を示しています。ラブドウイルスは狂犬病ウイルスを含む一本鎖RNAウイルスの仲間です。
Fossil rhabdoviral sequences integrated into arthropod genomes: ontogeny, evolution and potential functionality.
Fort P, Albertini A, Van-Hua A, Berthomieu A, Roche S, Delsuc F, Pasteur N, Capy P, Gaudin Y, Weill M.
Mol Biol Evol. 2012 Jan;29(1):381-90. Epub 2011 Sep 13.
PMID: 21917725 [PubMed - in process]
著者らはラブドウイルスの配列が節足動物のゲノムにだけ挿入されている事を報告し、その配列の詳細を解析している。そのほとんどは、Aedes aegyptiとIxodes scapularisのゲノムから見つかり、一部の配列では負の淘汰圧が認められた。つまり、一部のラブドウイルス由来の配列は宿主の生存に有利に働いている可能性がある。
Aedes aegyptiは大量の転移因子を蓄積している事がわかっています。我々の仮説に従えば、このラブドウイルス由来の配列の挿入は集団サイズの縮小に伴って遺伝的浮動により蓄積された可能性があります。ただ、この論文のデータの場合には、逆転写酵素の活性が必須なので、レトロトランスポゾンの活性化に伴ってRNAウイルスの逆転写が頻繁に起こった可能性は否定できません。
2012年3月31日土曜日
2012年3月30日金曜日
ミトコンドリアでのテロメラーゼの役割
利己的遺伝因子の最古の家畜化の1つであるテロメラーゼタンパク質はテロメア反復配列の付加だけでなく、いろいろな経路に関わっていることが最近わかってきています。
Human telomerase acts as a hTR-independent reverse transcriptase in mitochondria
Sharma NK, Reyes A, Green P, Caron MJ, Bonini MG, Gordon DM, Holt IJ, Santos JH.
Nucleic Acids Res. 2012 Jan;40(2):712-25. Epub 2011 Sep 21.
PMID: 21937513 [PubMed - indexed for MEDLINE] Free PMC Article
テロメア反復配列を伸ばす役割を持つヒトのテロメラーゼのタンパク質部分(hTERT)は逆転写酵素の一種です。hTERTは核以外にミトコンドリアにも局在することが知られていましたが、その機能は不明でした。この論文では、ミトコンドリアにはテロメラーゼRNAは存在しないこと、しかしミトコンドリアにおけるhTERTの影響は逆転写酵素活性に依存していること、hTERTがミトコンドリア内でtRNAなどと結合していることを示しています。
Human telomerase acts as a hTR-independent reverse transcriptase in mitochondria
Sharma NK, Reyes A, Green P, Caron MJ, Bonini MG, Gordon DM, Holt IJ, Santos JH.
Nucleic Acids Res. 2012 Jan;40(2):712-25. Epub 2011 Sep 21.
PMID: 21937513 [PubMed - indexed for MEDLINE] Free PMC Article
テロメア反復配列を伸ばす役割を持つヒトのテロメラーゼのタンパク質部分(hTERT)は逆転写酵素の一種です。hTERTは核以外にミトコンドリアにも局在することが知られていましたが、その機能は不明でした。この論文では、ミトコンドリアにはテロメラーゼRNAは存在しないこと、しかしミトコンドリアにおけるhTERTの影響は逆転写酵素活性に依存していること、hTERTがミトコンドリア内でtRNAなどと結合していることを示しています。
2012年3月29日木曜日
彗星の衝突がヤンガー・ドリアス期を引き起こした?
ニュースによると1万2900年前ごろに北米大陸に彗星の衝突か空中爆発があったのが気候変動を引き起こしたという説が唱えられたようです。
縄文時代にも大規模な彗星衝突か 米などの研究チーム
北米大陸には剣歯虎やマンモスなどの大型の哺乳類が多数生息していました。しかし人類の到達と前後してこれらの大型動物たちは絶滅してしまいます。このため、人類による狩猟が大型哺乳類の絶滅の原因だという考えが長らく支配的でした。しかし、実際には、大型動物の減少は人類の到達以前から始まっていた可能性が高いことがわかってきており、今回の報告もその流れに沿ったもののようです。
Evidence from central Mexico supporting the Younger Dryas extraterrestrial impact hypothesis
Israde-Alcántara I, Bischoff JL, Domínguez-Vázquez G, Li HC, Decarli PS, Bunch TE, Wittke JH, Weaver JC, Firestone RB, West A, Kennett JP, Mercer C, Xie S, Richman EK, Kinzie CR, Wolbach WS.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Mar 5. 109 (13): E738-E747
PMID: 22392980 [PubMed - as supplied by publisher] Free Article
縄文時代にも大規模な彗星衝突か 米などの研究チーム
北米大陸には剣歯虎やマンモスなどの大型の哺乳類が多数生息していました。しかし人類の到達と前後してこれらの大型動物たちは絶滅してしまいます。このため、人類による狩猟が大型哺乳類の絶滅の原因だという考えが長らく支配的でした。しかし、実際には、大型動物の減少は人類の到達以前から始まっていた可能性が高いことがわかってきており、今回の報告もその流れに沿ったもののようです。
Evidence from central Mexico supporting the Younger Dryas extraterrestrial impact hypothesis
Israde-Alcántara I, Bischoff JL, Domínguez-Vázquez G, Li HC, Decarli PS, Bunch TE, Wittke JH, Weaver JC, Firestone RB, West A, Kennett JP, Mercer C, Xie S, Richman EK, Kinzie CR, Wolbach WS.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Mar 5. 109 (13): E738-E747
PMID: 22392980 [PubMed - as supplied by publisher] Free Article
2012年3月28日水曜日
恐竜絶滅以前の多丘歯目哺乳類の適応放散
脊椎動物の歴史において中生代は爬虫類の時代、新生代は哺乳類の時代だとよく言われます。実際には新生代は鳥類の時代でもあるのですが、それはさておき、哺乳類の祖先は本当に中生代には恐竜のおかげで肩身の狭い思いをしていたのでしょうか?
Adaptive radiation of multituberculate mammals before the extinction of dinosaurs
Wilson GP, Evans AR, Corfe IJ, Smits PD, Fortelius M, Jernvall J.
Nature. 2012 Mar 14;483(7390):457-60. doi: 10.1038/nature10880.
PMID: 22419156 [PubMed - in process]
哺乳類は一般に恐竜が白亜紀末に絶滅した後に恐竜のくびきから解放されて多様化したと考えられています。しかし一方で哺乳類の中生代の化石には多様性が認められますを。著者らは中生代に繁栄した哺乳類のグループ多丘歯類の生態的多様性を体系的に解析しています。それによると多丘歯類の多様化は恐竜絶滅の2000万年以上前には始まっており、顎の形態から、食虫性から食植性への進化がはっきりと示されました.これらのことは哺乳類の多様化が恐竜の絶滅によって始まったのではなく、被子植物の進化によって引き起こされたのだということを示しています。
Adaptive radiation of multituberculate mammals before the extinction of dinosaurs
Wilson GP, Evans AR, Corfe IJ, Smits PD, Fortelius M, Jernvall J.
Nature. 2012 Mar 14;483(7390):457-60. doi: 10.1038/nature10880.
PMID: 22419156 [PubMed - in process]
哺乳類は一般に恐竜が白亜紀末に絶滅した後に恐竜のくびきから解放されて多様化したと考えられています。しかし一方で哺乳類の中生代の化石には多様性が認められますを。著者らは中生代に繁栄した哺乳類のグループ多丘歯類の生態的多様性を体系的に解析しています。それによると多丘歯類の多様化は恐竜絶滅の2000万年以上前には始まっており、顎の形態から、食虫性から食植性への進化がはっきりと示されました.これらのことは哺乳類の多様化が恐竜の絶滅によって始まったのではなく、被子植物の進化によって引き起こされたのだということを示しています。
2012年3月27日火曜日
不完全な擬態
昆虫のハチ、アリに擬態している昆虫は多数存在します。ハチに擬態した虎縞模様を持つ昆虫としては、ガ、カミキリムシ、などが知られていますが、最も多くみかけるのはアブの仲間ではないでしょうか?
A comparative analysis of the evolution of imperfect mimicry
Penney HD, Hassall C, Skevington JH, Abbott KR, Sherratt TN.
Nature. 2012 Mar 21;483(7390):461-4. doi: 10.1038/nature10961.
PMID: 22437614 [PubMed - in process]
ハナアブ(hoverfly)はハチの仲間に擬態しているハエの仲間です。彼らのベイツ型擬態は完璧なものもあれば、完璧とはとても言いがたいようないい加減なものもあります。この論文では何故いい加減な擬態が成立しているのかを調べています。その答えは、ハナアブは小さくて餌としてはあまり魅力が無いため。体のサイズと擬態の完璧さは相関しており、餌として魅力的な大型の種では擬態を完璧に近づけないと捕食されてしまうらしい。
A comparative analysis of the evolution of imperfect mimicry
Penney HD, Hassall C, Skevington JH, Abbott KR, Sherratt TN.
Nature. 2012 Mar 21;483(7390):461-4. doi: 10.1038/nature10961.
PMID: 22437614 [PubMed - in process]
ハナアブ(hoverfly)はハチの仲間に擬態しているハエの仲間です。彼らのベイツ型擬態は完璧なものもあれば、完璧とはとても言いがたいようないい加減なものもあります。この論文では何故いい加減な擬態が成立しているのかを調べています。その答えは、ハナアブは小さくて餌としてはあまり魅力が無いため。体のサイズと擬態の完璧さは相関しており、餌として魅力的な大型の種では擬態を完璧に近づけないと捕食されてしまうらしい。
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