レンスキーらの実験の紹介と順番が逆になったが、リチャードドーキンスの最近の著書「進化の存在証明」を読み終えたので感想。原題は「The Greatest Show on Earth - The Evidence for Evolution」。進化論を信じない人があまりに多いのを嘆いて書かれた本なので、基本的には詳細に何故進化が真実と考えられるのかを丁寧に解説している。
アメリカでは実に4割の人が進化を信じていないという｡これまではなんて頑迷なキリスト教徒たちなのだろうと思っていたのだが､どうやら違うらしいことがこの本を読んでいるうちにわかった。これらの人たちのほとんどは単に基本的な科学の知識がないだけなのだ。そして一部の進化を理解していながら感情的に受けつけない人たちが彼らを洗脳すべくエセ科学を振りかざしている｡そういう構図のようだ。今年は大統領選の年なのでこういう問題は一層悩ましいものである。
2012年10月24日水曜日
2012年10月23日火曜日
レンスキーらの進化実験
最近読み終わった「進化の存在証明」で紹介されていたレンスキーらの実験の、続報が出ていました。紹介されていた研究は､12系統の大腸菌をひたすら継代し続けるというものです。グルコースを添加した培地で維持し続けると、よりその環境で増殖に適した変異を持った個体が増殖することになります。そしてすぐに上限に達するのですが､あるとき、
とても濃い密度まで増加できる株が出現しました。その後の研究でこれは培地にpH調整のために添加されていたクエン酸をエネルギー源として利用できるように進化したためであることがわかりました。
Genomic analysis of a key innovation in an experimental Escherichia coli population
Blount ZD, Barrick JE, Davidson CJ, Lenski RE.
Nature. 2012 Sep 27;489(7417):513-8. doi: 10.1038/nature11514. Epub 2012 Sep 19.
PMID: 22992527 [PubMed - in process]
さて、今回の報告では､これらの株の継代中のゲノム配列の変化を調べています。クエン酸を利用できるようになるよりも10000継代も前から培養液中では3種類の遺伝子型が共存しており、その内の１つでタンデム遺伝子重複が起こり､クエン酸トランスポーターの遺伝子が発現するようになったということがわかりました。
とても濃い密度まで増加できる株が出現しました。その後の研究でこれは培地にpH調整のために添加されていたクエン酸をエネルギー源として利用できるように進化したためであることがわかりました。
Genomic analysis of a key innovation in an experimental Escherichia coli population
Blount ZD, Barrick JE, Davidson CJ, Lenski RE.
Nature. 2012 Sep 27;489(7417):513-8. doi: 10.1038/nature11514. Epub 2012 Sep 19.
PMID: 22992527 [PubMed - in process]
さて、今回の報告では､これらの株の継代中のゲノム配列の変化を調べています。クエン酸を利用できるようになるよりも10000継代も前から培養液中では3種類の遺伝子型が共存しており、その内の１つでタンデム遺伝子重複が起こり､クエン酸トランスポーターの遺伝子が発現するようになったということがわかりました。
2012年10月19日金曜日
イタチの内在性レンチウイルス
ヒト免疫不全ウイルス（HIV）などのレンチウイルスは長らく内在性レトロウイルスにはならないと考えられてきたが、近年になって、ウサギやサルから内在性レンチウイルスが見つかって来ている。
Endogenous Lentiviral Elements in the Weasel Family (Mustelidae)
Han GZ, Worobey M.
Mol Biol Evol. 2012 Oct;29(10):2905-8. Epub 2012 Apr 20.
PMID: 22522310 [PubMed - in process]
この論文ではイタチから新規の内在性レンチウイルスMustelidae endogenous lentivirus [MELV]を報告している。イタチ類の中でも、カワウソ亜科 Lutrinaeとイタチ亜科 MustelinaeではMELVが見つかったが、テンの仲間Martinaeでは見つからなかった。このことから、MELVがイタチ類のゲノムに挿入されたのは、1180万年前から880万年前ごろと推定された。
Endogenous Lentiviral Elements in the Weasel Family (Mustelidae)
Han GZ, Worobey M.
Mol Biol Evol. 2012 Oct;29(10):2905-8. Epub 2012 Apr 20.
PMID: 22522310 [PubMed - in process]
この論文ではイタチから新規の内在性レンチウイルスMustelidae endogenous lentivirus [MELV]を報告している。イタチ類の中でも、カワウソ亜科 Lutrinaeとイタチ亜科 MustelinaeではMELVが見つかったが、テンの仲間Martinaeでは見つからなかった。このことから、MELVがイタチ類のゲノムに挿入されたのは、1180万年前から880万年前ごろと推定された。
2012年10月18日木曜日
mutator変異と転移因子の競合関係
真核生物の転移因子を扱っている私にとってはMutatorというと植物のトランスポゾンなのですが、原核生物ではDNA修復系の変異の名前ですね。
Competition between Transposable Elements and Mutator Genes in Bacteria
Fehér T, Bogos B, Méhi O, Fekete G, Csörgo B, Kovács K, Pósfai G, Papp B, Hurst LD, Pál C.
Mol Biol Evol. 2012 Oct;29(10):3153-9. Epub 2012 Apr 23.
PMID: 22527906 [PubMed - in process]
mutator変異と転移因子はどちらも突然変異率を上げる。この論文では、転移因子を全て除いた大腸菌にIS1を導入し、その挙動を調べている。確かにIS1は突然変異率を増加させ、時折全く異なった表現型を示す株を作るが、その適応進化における効果はmutatorに比べると小さかった。そしてmutator変異は転移因子の増殖を抑える効果があった。従ってmutator変異と転移因子は変異誘発系として競合関係にあると言える。
Competition between Transposable Elements and Mutator Genes in Bacteria
Fehér T, Bogos B, Méhi O, Fekete G, Csörgo B, Kovács K, Pósfai G, Papp B, Hurst LD, Pál C.
Mol Biol Evol. 2012 Oct;29(10):3153-9. Epub 2012 Apr 23.
PMID: 22527906 [PubMed - in process]
mutator変異と転移因子はどちらも突然変異率を上げる。この論文では、転移因子を全て除いた大腸菌にIS1を導入し、その挙動を調べている。確かにIS1は突然変異率を増加させ、時折全く異なった表現型を示す株を作るが、その適応進化における効果はmutatorに比べると小さかった。そしてmutator変異は転移因子の増殖を抑える効果があった。従ってmutator変異と転移因子は変異誘発系として競合関係にあると言える。
2012年10月17日水曜日
自尊心のある人ならば
改めて､先日読んだ遺伝子重複による進化から、とても気に入った言葉を引用したい。
「基礎科学に携わる研究者で自尊心のある人ならば誰でもが望むように、次世代の生物学者の考え方に影響を与えたいと思うならば、実験データの単なる生産者であるという水準から抜きんでて、新しい概念を明確に提示する者とならねばならない」
日本語版への序にある言葉なのだが、正に至言。
「基礎科学に携わる研究者で自尊心のある人ならば誰でもが望むように、次世代の生物学者の考え方に影響を与えたいと思うならば、実験データの単なる生産者であるという水準から抜きんでて、新しい概念を明確に提示する者とならねばならない」
日本語版への序にある言葉なのだが、正に至言。
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