論文メモ。似たような論文をたくさん見ているような気がするのですが何故でしょう？？
Alu repeat discovery and characterization within human genomes
Hormozdiari F, Alkan C, Ventura M, Hajirasouliha I, Malig M, Hach F, Yorukoglu D, Dao P, Bakhshi M, Sahinalp SC, Eichler EE.
Genome Res. 2011 21(6): 840-849
8人のヒトゲノムを解析し､ヒトのreference genomeにない4342のAluの挿入を発見した｡そのうち89%はAluYに属すことがわかった。またアフリカ人は非アフリカ人に比べて未発見の位置への挿入の頻度が高かった｡（これはアフリカ人で転移頻度が高いことを示すわけではなく､アフリカ人は非アフリカ人に比べて遺伝的に多様であることを示している｡）
同様のことはL1についても言えます｡
Whole-genome resequencing allows detection of many rare LINE-1 insertion alleles in humans
Ewing AD, Kazazian HH Jr.
Genome Res. 2011 21(6): 985-990
ヒトのreference genomeにない1016のL1の挿入が見つかった｡これらのほとんどは単一の解析でだけ見つかる挿入であることから頻度の低い型であり、とりわけアフリカ人に多かった｡
同じ号に関連する総説が載っています｡
Reading TE leaves: New approaches to the identification of transposable element insertions
Ray DA, Batzer MA.
Genome Res. 2011 21(6): 813-820
2011年7月4日月曜日
2011年7月3日日曜日
ライフサイエンス 新着論文レビュー
たまたま、大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンターの提供しているライフサイエンス 新着論文レビュー First Author'sというサイトを見つけました｡
原著論文のAbstractの日本語訳を著者自身が提供するだけでも、日本人にとってずいぶんと便利になるのではないかと考えていたところです｡上記のサイトは著者自身が書いた内容が掲載される点では同じですが､掲載が一部のジャーナルに限定される点では私の思い描いていたものとは少し違います｡
科学業界では英語が標準語とはいえ､やはり日本人にとっては日本語の情報源の方がはるかに理解に時間がかからず、効率的に利用できます。言語構造も日本語と英語では根本的に異なり､ヨーロッパ語圏の人たちが英語を理解するようには簡単に理解できないのも事実です｡そしてそれ以上に非研究者や、研究者でもその分野以外の人たちへの情報発信という点では､やはり日本語での情報提供にはそれだけの価値があると思います｡
原著論文のAbstractの日本語訳を著者自身が提供するだけでも、日本人にとってずいぶんと便利になるのではないかと考えていたところです｡上記のサイトは著者自身が書いた内容が掲載される点では同じですが､掲載が一部のジャーナルに限定される点では私の思い描いていたものとは少し違います｡
科学業界では英語が標準語とはいえ､やはり日本人にとっては日本語の情報源の方がはるかに理解に時間がかからず、効率的に利用できます。言語構造も日本語と英語では根本的に異なり､ヨーロッパ語圏の人たちが英語を理解するようには簡単に理解できないのも事実です｡そしてそれ以上に非研究者や、研究者でもその分野以外の人たちへの情報発信という点では､やはり日本語での情報提供にはそれだけの価値があると思います｡
2011年7月2日土曜日
真珠のゲノム？
タイトルを見て、"真珠"の遺伝子？と思いましたが､
＜真珠＞全遺伝子を特定 美しさの謎に迫る…東大などチーム
アコヤガイのESTを次世代シーケンサーで解読したという話のようです。
Deep Sequencing of ESTs from Nacreous and Prismatic Layer Producing Tissues and a Screen for Novel Shell Formation-Related Genes in the Pearl Oyster
＜真珠＞全遺伝子を特定 美しさの謎に迫る…東大などチーム
アコヤガイのESTを次世代シーケンサーで解読したという話のようです。
Deep Sequencing of ESTs from Nacreous and Prismatic Layer Producing Tissues and a Screen for Novel Shell Formation-Related Genes in the Pearl Oyster
2011年7月1日金曜日
真菌っぽくない真菌
論文メモ。
Discovery of novel intermediate forms redefines the fungal tree of life
真菌類は一般的にキチン質の細胞壁を持ち､細胞外で消化した栄養を細胞に取り込む能力を持つ｡著者らは初期に分岐した真菌類を発見し､cryptomycotaと名付けた｡リボソームRNAの配列による系統樹ではcryptomycotaはRozellaと一緒に真菌類での最初の分岐となった｡cryptomycotaはキチン質の細胞壁を持たない3-5ミクロンの細胞で鞭毛を作ることができる。
Discovery of novel intermediate forms redefines the fungal tree of life
真菌類は一般的にキチン質の細胞壁を持ち､細胞外で消化した栄養を細胞に取り込む能力を持つ｡著者らは初期に分岐した真菌類を発見し､cryptomycotaと名付けた｡リボソームRNAの配列による系統樹ではcryptomycotaはRozellaと一緒に真菌類での最初の分岐となった｡cryptomycotaはキチン質の細胞壁を持たない3-5ミクロンの細胞で鞭毛を作ることができる。
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