2011年5月18日水曜日

Sea otters at Moss Landing

ラッコが近くで見られることで有名なMoss Landing State Beachに行ってきました。モントレーでがんばって遠くのラッコを覗いていたのがばからしくなるくらいに近くにラッコが漂っていました。我々が行ったときで30-40頭くらい。湾になっていて波がほとんどないためかラッコも大変くつろいでいました。
ただ、ボートで近づくのはお勧めできません。ラッコが逃げてしまうし、写真も撮れないので多分悲しいです。

2011/04/10撮影。




2011年5月17日火曜日

イヌカタヒバのゲノム

The Selaginella Genome Identifies Genetic Changes Associated with the Evolution of Vascular Plants.
Banks JA, Nishiyama T, Hasebe M, Bowman JL, Gribskov M, Depamphilis C, Albert VA, Aono N, Aoyama T, Ambrose BA, Ashton NW, Axtell MJ, Barker E, Barker MS, Bennetzen JL, Bonawitz ND, Chapple C, Cheng C, Correa LG, Dacre M, Debarry J, Dreyer I, Elias M, Engstrom EM, Estelle M, Feng L, Finet C, Floyd SK, Frommer WB, Fujita T, Gramzow L, Gutensohn M, Harholt J, Hattori M, Heyl A, Hirai T, Hiwatashi Y, Ishikawa M, Iwata M, Karol KG, Koehler B, Kolukisaoglu U, Kubo M, Kurata T, Lalonde S, Li K, Li Y, Litt A, Lyons E, Manning G, Maruyama T, Michael TP, Mikami K, Miyazaki S, Morinaga SI, Murata T, Mueller-Roeber B, Nelson DR, Obara M, Oguri Y, Olmstead RG, Onodera N, Petersen BL, Pils B, Prigge M, Rensing SA, Riaño-Pachón DM, Roberts AW, Sato Y, Scheller HV, Schulz B, Schulz C, Shakirov EV, Shibagaki N, Shinohara N, Shippen DE, Sørensen I, Sotooka R, Sugimoto N, Sugita M, Sumikawa N, Tanurdzic M, Theißen G, Ulvskov P, Wakazuki S, Weng JK, Willats WW, Wipf D, Wolf PG, Yang L, Zimmer AD, Zhu Q, Mitros T, Hellsten U, Loqué D, Otillar R, Salamov A, Schmutz J, Shapiro H, Lindquist E, Lucas S, Rokhsar D, Grigoriev IV.
Science. 2011 May 5. [Epub ahead of print]

ヒカゲノカズラ植物の初のゲノム解読。維管束植物は大きく真葉植物(種子植物+大葉シダ類)と小葉植物(小葉シダ類)の二つの系統からなるが、後者がヒカゲノカズラ植物門である。

2011年5月16日月曜日

Repbase Reports 11(4)

しばらく前になりますが、Repbase Reportsの今年第4号が公開されました。今号は黄熱病を媒介するネッタイシマカAedes aegyptiのnon-LTR retrotransposonを主に報告しています。
Repbase Reports 2011, Volume 11, Issue 4

2011年5月15日日曜日

第63回LSJ/第51回JBC ジョイント・フォーラム

先先週の金曜日にタイトルにあるミッキー・グレースさんの論文の書き方講座を聴いてきました。内容は、タイトルに「Study of ~」は使わない方が良いとか、いわゆる良く聞く内容が多かったのですが、いろいろと新しい発見もありました。その後はPalo Altoのピザ屋で二次会に参加。Japan Bio CommunityはLife Science in Japanese/Research at Stanfordと違って研究者以外も多く、二次会も興味深い話が聞けました。

Life Science in Japanese
Japan Bio Community

2011年5月10日火曜日

植物の進化とゲノム倍化

論文メモ。メモはほとんど要約だけ読んで書いています。

Ancestral polyploidy in seed plants and angiosperms
Jiao Y, Wickett NJ, Ayyampalayam S, Chanderbali AS, Landherr L, Ralph PE, Tomsho LP, Hu Y, Liang H, Soltis PS, Soltis DE, Clifton SW, Schlarbaum SE, Schuster SC, Ma H, Leebens-Mack J, Depamphilis CW.
Nature. 2011 May 5;473(7345):97-100. Epub 2011 Apr 10.

植物はゲノム倍加によって多様な性質を進化させることが知られている。著者らは解読された植物ゲノム中の遺伝子の並び順を解析することで2回のゲノム倍加が起こっていることを示す結果を得た。一つは被子植物の共通祖先、もう一つは種子植物の共通祖先である。遺伝子重複は3億1900万年前と1億9200万年前に集中しており、ゲノム重複がこの時期に起こったことを示唆している。これらのゲノム重複により種子の発生と花の発生に重要な調節因子が多様化した。