その他の利己的遺伝子関係論文まとめ

Diversity of bacterial type II toxin–antitoxin systems: a comprehensive search and functional analysis of novel families
Leplae R, Geeraerts D, Hallez R, Guglielmini J, Drèze P, Van Melderen L.
Nucleic Acids Res. 2011 Jul;39(13):5513-25. Epub 2011 Mar 21.
PMID: 21422074 [PubMed - indexed for MEDLINE] Free PMC Article
Type II toxin–antitoxin (TA) systemをバイオインフォマティクスで探索した論文。TA systemはプラスミドだけでなく、染色体の安定した伝播にも寄与しているらしい。

The Repertoire of ICE in Prokaryotes Underscores the Unity, Diversity, and Ubiquity of Conjugation　OPEN ACCESS
Guglielmini J, Quintais L, Garcillán-Barcia MP, de la Cruz F, Rocha EP.
PLoS Genet. 2011 Aug;7(8):e1002222. Epub 2011 Aug 18.
原核生物の利己的遺伝因子、integrative conjugative elements (ICE)の総論。ICEは接合を媒介し、ゲノムに挿入されるタイプの利己的遺伝因子。

Non-specific protein–DNA interactions control I-CreI target binding and cleavage
Molina R, Redondo P, Stella S, Marenchino M, D'Abramo M, Gervasio FL, Charles Epinat J, Valton J, Grizot S, Duchateau P, Prieto J, Montoya G.
Nucleic Acids Res. 2012 Aug 1;40(14):6936-45. Epub 2012 Apr 11.
PMID: 22495931 [PubMed - in process] Free PMC Article
Homing endonucleaseの１種I-CreIのDNA認識の機構を解析した論文。

Transposable Elements, Epigenetics, and Genome Evolution
Fedoroff NV.
Science. 2012 Nov 9;338(6108):758-67. No abstract available.
PMID: 23145453 [PubMed - indexed for MEDLINE] Free Article
転移因子の概説記事。

Transposon integration enhances expression of stress response genes
Feng G, Leem YE, Levin HL.
Nucleic Acids Res. 2013 Jan;41(2):775-89. doi: 10.1093/nar/gks1185. Epub 2012 Nov 27.
PMID: 23193295 [PubMed - in process] Free PMC Article
Tf1はストレス応答性の遺伝子のプロモータ領域に挿入する傾向がある。Tf1の挿入はこれらの遺伝子の転写を抑制しない。Tf1のエンハンサー活性は熱により活性化され、熱応答性遺伝子の熱への応答を強める働きをも持つ。